1.小规模纳税人的税种申报是：按月在自然人代扣代缴系统申报个人所得税，按季度在电子税务局申报增值税，附加税以及企业所得税；

2.个体户的税种申报是：按月在自然人代扣代缴系统申报个人所得税，按季度在电子税务局申报增值税，附加税，在自然人代扣代缴系统申报个人生产经营所得税。

综上所述，其实两者报税的不同在于小规模公司是申报企业所得税，而个体户不属于公司，所以是申报个人生产经营所得税。

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